Tulžies takų komplikacijos po kepenų transplantacijos išsivysto 10–20 % atvejų. Tai striktūros, tulžies nutekėjimas, fistulės ir cholangitas. Gali būti stebimos anastomozių striktūros, atsiradusios dėl techninių klaidų, uždegimas dėl tulžies nutekėjimo ir fibrozės, taip pat su anastomozėmis nesusijusios striktūros, susidarančios virš anastomozės porta hepatitis kryptimi, kai kuriais atvejais atsiradusios dėl latako išemijos.