Įgimtos širdies ydos yra viena iš dažniausių raidos anomalijų, užimanti trečią vietą po centrinės nervų sistemos ir raumenų bei skeleto sistemos anomalijų. Vaikų, turinčių įgimtų širdies ydų, gimstamumas visose pasaulio šalyse svyruoja nuo 2,4 iki 14,2 iš 1000 naujagimių. Įgimtų širdies ydų dažnis tarp gyvų gimusiųjų yra 0,7–1,2 iš 1000 naujagimių.