Vilkligės nefritas yra tipiškas imuninių kompleksų nefritas, kurio išsivystymo mechanizmas atspindi sisteminės raudonosios vilkligės patogenezę kaip visumos. Sergant sistemine raudonąja vilklige, vyksta polikloninė B ląstelių aktyvacija, kurią gali sukelti tiek pirminis genetinis defektas, tiek T limfocitų disfunkcija ir CD4+ bei CD8+ ląstelių santykio sumažėjimas.