Hipoksija yra deguonies trūkumas, būklė, atsirandanti, kai organizmo audiniams nepakanka deguonies arba sutrinka jo panaudojimas biologinio oksidacijos procese, lydi daugelį patologinių būklių, yra jų patogenezės sudedamoji dalis ir kliniškai pasireiškia hipoksiniu sindromu, kuris yra pagrįstas hipoksemija.