Smilkininio apatinio žandikaulio sąnario MRT yra perspektyvus būdas diagnozuoti kaukolės kaulų motorinės funkcijos sutrikimus. Tai leidžia greitai, nepažeidžiant minkštųjų audinių vientisumo, įvertinti anatomines ypatybes ir galimus sąnario kaulų pažeidimus, jo inervaciją, veido raumenų būklę, suteikiant gydytojui svarbią informaciją, leidžiančią tiksliai diagnozuoti.